Gel Analyzer

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Das CompositeImage ist neu überarbeitet.

 

Darüber hinaus wurde MovieController innerhalb von CollapsiblePane entfernt. Der Animationsframe ist nun unter Menu Plugins>Utilities->Animation Frame sowie Toolbox und JColor Pane erreichbar.

 

Gel Analyzer ControlBar

Verwenden Sie die Befehle in der Menübar "Gel Analyser", um eindimensionale Elektrophorese-Gele zu analysieren. Diese Befehle verwenden eine einfache grafische Methode. Sie beinhalten die Erzeugung von Laneprofil Plots, die Eingrenzung von "Peaks der Interessen" mit Zeichnung von Linien (d.h. bestimmte Integrale) und die Peakflächen unter Verwendung des Zauberstab-Werkzeuges. 
Bitte beachten Sie, dass diese Technik nicht verwendet werden kann, um Lanes auf verschiedenen Gelen zu vergleichen - es sei denn, die Gele werden mit bekannten Standards kalibriert.


 
Die in dieser Menübar aufgeführten Befehle sind:

1: SR (Set ROI) Taste zur Erzeugung einer rechteckigen Auswahl.
2: FL (First Lane) FL erfordert eine rechteckige Auswahl.
3: NL (Next Lane ) Falls Sie NL drücken, ohne ROI neu zu positionieren, wird die Auswahl um die Auswahlbreite erweitert; anderenfalls wird nur die neu positionierte Auswahl markiert. Bitte beachten Sie, dass jede Auswahl die gleichen Abmessungen haben muss.
4: PL (Plot Lane) generiert die Lane Profilplots. ImageJ2x geht davon aus, dass nur ein Plot pro Analyse erstellt wird. Bei Wiederholung wird eine Fehlermeldung herausgegeben.                   
5: RL (Replot Lane) ist die Ausgabe eines wiederholten PL-Befehls, jedoch ohne Fehlermeldung, falls der PL-Befehl ausgeführt wurde.
6: RS (Reset) setzt die Analyse zurück.
7: LP (Label Peaks) ist die Flächenmessung mit dem Zauberstab-Werkzeug, um Lane-Spitzen zu kennzeichnen. 
8: Opt (Option) Verwenden Sie diesen Dialog, um das Verhalten des Gel Analyzer zu steuern. Der vertikale / horizontale Skalierungsfaktor gibt den Maßstabsfaktor an, bei dem die Laneprofil-Plots angezeigt werden.

9: i (Info) Bildinformationen.

 

 

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